Как только вы нажимаете кнопку "Сохранить" на странице настроек темы, Вебасист сохраняет копию вашей темы в отдельную папку, и далее на страницах вашего сайта используется именно эта копия. Это сделано для того, чтобы обновления тем через Инсталлер не сбросили изменения в ваших настройках и шаблонах, т.е. Инсталлер обновляет только исходную копию темы.
Если вы не вносили изменения в шаблоны темы, можно просто открыть страницу настроек темы сразу в двух вкладках браузера, в одной кликнуть на ссылку Сбросить все изменения", а во второй нажать кнопку "Сохранить". Эту операцию нужно выполнить для приложения "Сайт" и повторить для тех приложений, где вы сохраняли какие-либо настройки.
Если шаблоны все же были изменены, Инсталлер при обновлении предупредит вас об этом. В этом случае у вас есть выбор: обновить все файлы или не обновлять тему совсем.
ВНИМАНИЕ! Не рекомендуется обновлять темы, игнорируя отдельные шаблоны - это может нарушить работу витрины вашего Магазина!
В некоторых случаях также может потребоваться "Очистить кеш". Это делается с помощью кнопки на странице "Инсталлер" - "Настройки".